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较真要点:1、 从中国 简历大全

女人资料网  发表于:2020-07-18 08:34:54
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较真要点:

1、 从中国疾控中心公布的病毒基因序列来看,此次北京新发地检出的新冠病毒更接近欧洲流行的病毒株,意味着这次的新冠病毒极有可能是从欧洲,或者从被欧洲分支相应病毒所感染的区域输入。

2、 北京新发现的病毒株属于强传染性病毒株,检出的病毒带有此前研究发现的 D614G突变。有研究指出,变异后的病毒之所以能取得传播上的优势,是因为变异发生在新冠病毒的S蛋白区域,S蛋白区域的变异可能导致病毒更容易和细胞发生融合,从而增强其传染性。

3、 有研究发现,经D614G突变后的病毒株感染细胞能力明显提高,研究结果显示感染效率提高了9倍以上。但这是仅使用病毒的S蛋白感染细胞得出的结论,在现实中具体情况如何,还需要有流行病学证据支持,并不意味着实际生活中其感染力就能达到这个量级。

查证者:李雷丨中国科学院生物学博士

一、此次北京发现的新冠病毒在进化上更接近欧洲流行病毒株

6月18日,中国疾控中心发布了2020年6月北京新发地新冠疫情及病毒基因组序列数据,包括北京市确诊病例基因组序列数据(NMDC60013902-01、NMDC60013903-02)以及环境样本基因组序列数据(NMDC60013903-03)。

从此次公布的病毒基因序列来看,三支病毒株在进化关系上属于同一进化枝,这意味着这三支病毒株应该是同一来源。

而这三者,从序列相似性上看和欧洲流行的病毒株更类似。下图是基于病毒基因变异绘制的进化树,红圈标注的是此次北京新冠病毒的序列,可以看出,红圈处总体上属于流行于欧洲地区的病毒株(黄绿色表示欧洲分支),而非年初流行于全国范围的亚洲病毒进化分支(蓝色表示亚洲分支)。这提示我们,此次的新冠病毒极有可能是从欧洲,或者被欧洲分支相应病毒所感染的区域输入。

二、北京新发现的病毒株属于强传染性病毒株

最让人担心的是,此次北京检测出的病毒株序列,均带有前期研究发现的病毒突变——“D614G”突变。所谓D614G突变指新冠病毒氨基酸序列的第614位由原来的天冬氨酸(Asparagine,缩写为D)变成了甘氨酸(Glycine,缩写为G),病毒株也从D614变为G614。

下图是北京此次上传的新冠病毒序列变异信息,红框圏出的地方就是D614G突变。

其实在3月之前,全世界流行的病毒株主要是D614,但是从3月起,新的突变株G614开始快速增加,并且迅速成为了占世界主流的病毒株,到了4月,全球的主要流行病毒株一半以上是G614。

D614为什么具有强传染性?美国洛斯阿拉莫斯国家实验室(Los Alamos National Laboratory)的一篇研究此前就对此进行了分析。研究发现,D614G变异发生在新冠病毒的S蛋白区域。S蛋白就是大家看到新冠病毒表面那些凸起的地方,也是新冠病毒命名中的“冠”的来源。S蛋白可以和我们细胞上的ACE2受体进行结合,使得我们的细胞将其当做正常物质吞入,从而发生感染,S蛋白对于新冠病毒来说就是一把开启细胞的钥匙。而这个D614G变异,恰好使得S蛋白结构发生了一些变化,降低了这个蛋白的两个亚基之间的作用力,作者认为这种改变可能有两种影响:

1、使病毒更容易和细胞发生融合,从而使传染性增强。

2、增加ADE效应。所谓ADE效应,是指“抗体依赖增强症”(antibody-dependent enhancement)。一般情况下,我们感染了病原体后会获得特异性免疫,且生成记忆细胞,这样下次感染的时候免疫就会迅速激活从而发挥作用。但是有的时候,这种特异性免疫反应是有害的,那就是如果病原体发生了变异再次入侵,机体没有辨别清楚,继续产生之前的免疫,这种免疫对于变异后的病原体是无效或者有限的。机体不再去应对新病原体,反而会帮助其侵入宿主细胞。结果就是感染后的人,会比没有抗体的人症状更严重。结合SARS病毒的研究,作者推测这种变异可能会导致ADE效应增加(此处仅为作者的推测,目前新冠肺炎是否存在ADE效应尚未完全确定)。

三、在多个研究中D614G变异使病毒的感染能力变强,但不代表实际场景中也能达到如此高的感染能力

来自佛罗里达州斯克里普研究院(Scripps Research Institute)的研究人员用新冠病毒关键蛋白S蛋白构建了D614和G614的伪病毒并用来感染人肾上皮细胞系293T,然后检测感染后细胞中的荧光变化,发现变异后的G614感染细胞能力明显提高,要高出D614一个数量级——感染效率提高9倍以上。

“9倍”听起来令人不寒而栗,但需要注意的是,这个是使用病毒的S蛋白感染细胞得出的结论,在现实中具体情况如何,还需要有流行病学证据支持,并不意味着实际生活中其感染力能达到9倍这么高,以下提到的研究也是同样的道理。

来自纽约基因组研究中心Neville E. Sanjana团队采取类似的策略构建了包含G614在内的新冠S蛋白伪病毒,然后用其来感染三种人体细胞,分别是肺细胞(A549)、肝脏细胞(Huh7.5)和结肠细胞(Caco-2),然后用流失细胞计数来检测感染后的荧光强度。

结果发现D614G变异在三种细胞系中均提高了伪病毒感染细胞的能力,提升比例达到2.4-7.7倍,在肝脏细胞中,这种变异后感染能力提升最为明显。

尽管北京新发生疫情中的病毒株均有携带D614G突变,但要知道这个突变并不是在此次北京疫情中才发生,突变株也不是仅在北京出现——6月之前,该类型的突变株就已经是世界主流的病毒株了。至于变异后的病毒株感染力究竟较变异前强了多少,实验室研究的数据并不能作为确定的结论,所以无需恐慌,相信严格的防控是可以将其控制住的。

本文编辑:ambergchen

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